Invasión Inca a fines del siglo XV y los primeros 25 años del siglo XVI.
Sebastián de Benalcázar lo funda en 1534, teniendo como patrono a San Luis.
En 1673 se realizó el traslado del Otavalo antiguo al nuevo asentamiento (actual urbe).
En 1580 empezó a funcionar el Obraje Mayor de Otavalo y el de Peguche desde 1613.
El 11 de noviembre de 1811 se eleva el Asiento de Otavalo a la categoría de Villa.
Otavalo fue cantonizado el 25 de junio de 1824, por el General Francisco de Paula Santander.
Otavalo fue elevada a la categoría de ciudad, mediante un decreto emitido por el Libertador Simón Bolívar, el 31 de Octubre de 1829.
El 16 de agosto de 1868 ocurre el terremoto en Ibarra; por su cercanía, la ciudad de Otavalo resultó severamente afectada.
En 1918 llegó el tren hasta San Rafael.
En 1952 inició la Fiesta del Yamor.
El 24 de marzo de 1913 se inauguró el servicio de energía eléctrica en la ciudad de Otavalo. La obra fue impulsada por los hermanos Tomás y Abel Pinto.